Ο ΕΦΕΠΑΕ είναι Αστική Μη Κερδοσκοπική Εταιρεία, με αντικείμενο τη Διαχείριση Δράσεων Κρατικών Ενισχύσεων, αποτελούμενος από τους κάτωθι 7 εταίρους (ενδιάμεσους φορείς του Γ΄Κ.Π.Σ.):
Οι εταιρείες αυτές έχουν πολυετή εμπειρία Διαχείρισης, κυρίως, Δράσεων Κρατικών Ενισχύσεων.
Στο Μετοχικό Κεφάλαιο ή/και στη Διοίκηση του ΕΦΕΠΑΕ και των εταίρων του συμμετέχουν οι περισσότερες Ελληνικές συλλογικές επιχειρηματικές οργανώσεις, καλύπτοντας το σύνολο της χώρας και όλους τους τομείς επιχειρηματικής δραστηριότητας.
Η έδρα της εταιρείας είναι στην Αθήνα, αλλά μέσω των εταίρων της και ενός υποκαταστήματος, καλύπτει γεωγραφικά όλη τη χώρα. Τα έμπειρα στελέχη του φορέα βρίσκονται κοντά στις πολύ μικρές, μικρές και μεσαίες επιχειρήσεις, αφενός διαχειριζόμενα τα ενταγμένα έργα (πιστοποιήσεις, πληρωμές κτλ) και αφετέρου παρέχοντας την αναγκαία τεχνική βοήθεια σε ζητήματα διαχείρισης.
Όργανα διοίκησης της εταιρείας είναι :
Ο ΕΦΕΠΑΕ λειτουργεί ανελλιπώς ως Ενδιάμεσος Φορέας Διαχείρισης Δράσεων Ενισχύσεων από το 2009, όταν και διαχειρίστηκε δράσεις του Ε.Π. Ανταγωνιστικότητα και Επιχειρηματικότητα (ΕΠΑΝ ΙΙ).
Οι εταίροι του λειτουργούσαν ως Ενδιάμεσοι Φορείς Διαχείρισης Δράσεων Ενισχύσεων από το 1996.
Ο στόχος της εταιρείας ΕΦΕΠΑΕ είναι η παροχή προς την εκάστοτε Αναθέτουσα Αρχή υψηλής ποιότητας υπηρεσιών διαχείρισης Δράσεων Ενισχύσεων του εκάστοτε Επιχειρησιακού Προγράμματος.